生物安全柜使用后的維護以及消毒也是重要的步驟，能讓生物安全柜更好的投入使用以及延長使用壽命。

清潔消毒

工作前的自凈和消毒

A.在工作前要讓生物安全柜的風機至少運行3-5分鐘，使柜內的空氣實現自凈。

B.安全柜的工作臺面、內壁（不包括送風濾器擴散板）和觀察窗的內表面使用70%酒精或其他中性消毒劑擦拭。消毒后再用無菌水或蒸餾水進行擦拭以清除殘余消毒劑。

C.放到安全柜的容器和材料的表面使用70%乙醇擦拭，以減少將環境的污染物帶到安全柜內。

D.定期對孵箱和冰箱進行消毒。

工作結束時的表面消毒

工作完成時，應對所有的容器和設備進行表面消毒并拿出安全柜。每天工作結束時，對安全柜進行表面消毒，包括工作臺面、安全柜的邊壁、后壁、玻璃懸窗內外側、紫外線燈管和電源輸出口以及包括試驗設備在內的所有物品。消毒劑可選擇70%酒精或其他中性消毒劑。

日常維護

定期清潔操作臺面和前窗玻璃；

保持室內空氣質量,延長過濾器使用壽命；

定期檢測紫外燈的照射強度,及時更換燈管；

長期不用應定期進行維護性運行；

過濾器應定期檢測，及時更換；

做好使用和維護記錄。